然而，临时组织的民众义军无法与满洲正规军和汉奸军的联盟对抗。

乙酉年七月初四嘉定城破后，清军蜂拥而入。

当屠城令下达之时，清兵&ldo;家至户到，小街僻巷，无不穷搜，乱草丛棘，必用长枪乱搅。

&rdo;

&ldo;市民之中，悬梁者，投井者，投河者，血面者，断肢者，被砍未死手足犹动者，骨肉狼籍。

&rdo;清兵&ldo;悉从屋上奔驰，通行无阻。

城内难民因街上砖石阻塞，不得逃生，皆纷纷投河死，水为之不流。

&rdo;

若见年轻美色女子，遂&ldo;日昼街坊当众□。

&rdo;有不从者，&ldo;用长钉钉其两手于板，仍逼淫之。

&rdo;（《嘉定乙酉纪事》）史家慨叹：&ldo;三屠留给这座城市是毁灭和不知道德为何物的幸存者。

&rdo;（魏斐德《洪业─满清开国史》）。

血腥屠杀之后，清兵便四出掠夺财物。

&ldo;兵丁每遇一人，辄呼蛮子献宝，其入悉取腰缠奉之，意满方释。

遇他兵，勒取如前。

所献不多，辄砍三刀。

至物尽则杀。

故僵尸满路，皆伤痕遍体，此屡砍位能非一人所致也。

&rdo;大屠杀持续了一日，约三万人遇害，&ldo;自西关至葛隆镇，浮尸满河，舟行无下篙处&rdo;。

更有甚者，清军&ldo;拘集民船，装载金帛、子女及牛马羊等物三百余船&rdo;，（《嘉定乙酉纪事》）满载而去。

除嘉定三屠外，还有屠江阴，屠昆山、屠嘉兴、屠常熟、屠广州、屠赣州、屠湘潭，此外还有，屠大同、屠四川等等，满清政府甚至勾结荷兰殖民者，攻屠思明州（厦门）义士百姓屠戮殆尽，尸积成山，血流成河。

清军攻陷昆山，屠城三日，&ldo;杀戮一空，其逃出城门践溺死者，妇女、婴孩无算。

昆山顶上僧寮中，匿妇女千人，小儿一声，搜戮殆尽，血流奔泻，如涧水暴下&rdo;！

（王家桢《研堂见闻杂记》）

1649年（永历三年顺治六年）郑亲王济尔哈朗占领湖南湘潭后的屠城；同年镇压大同总兵姜瓖为首的山西反清运动，&ldo;朕命大军围城，筑墙掘濠，使城内人不能逸出，然后用红衣火炮攻破，尽行诛戮&rdo;，不仅大同全城军民屠戮殆尽，&ldo;附逆抗拒&rdo;州县也不分良莠一概屠杀。

1650年尚可喜与耿继茂攻克广州时的屠城&ldo;再破广州，屠戮甚惨，居民几无噍类。

……累骸烬成阜，行人于二、三里外望如积雪。

因筑大坎痤焉，表曰共冢。